IID

Q5JQS5_Q8NGF3.5 contacts (residues)

Receptor	R: Secondary Structure	R: Residue	R; Chain	R: Residue number	Ligand	L: Secondary Structure	L: Residue	L: Chain	L: Residue Number
R	H	GLY	A	228	L	H	VAL	V	33
R	H	ARG	A	245	L	H	TRP	V	313
R	H	ARG	A	245	L	-	GLY	V	317
R	H	ILE	A	255	L	H	LEU	V	41
R	H	ILE	A	255	L	H	LEU	V	44
R	H	LEU	A	258	L	H	LEU	V	37
R	H	LEU	A	258	L	H	LEU	V	41
R	H	CYS	A	259	L	H	PHE	V	292
R	H	CYS	A	259	L	H	LEU	V	41
R	H	LEU	A	262	L	H	VAL	V	34
R	H	LEU	A	262	L	H	LEU	V	37
R	H	LEU	A	262	L	H	SER	V	38
R	H	LEU	A	262	L	H	LEU	V	41
R	H	VAL	A	263	L	H	LEU	V	289
R	H	VAL	A	266	L	H	ILE	V	285
R	H	VAL	A	266	L	H	VAL	V	34
R	H	ILE	A	269	L	H	VAL	V	34
R	H	GLY	A	270	L	H	PHE	V	281
R	H	VAL	A	273	L	-	ARG	V	24
R	H	VAL	A	273	L	H	LEU	V	27
R	H	VAL	A	273	L	H	PHE	V	277
R	H	VAL	A	274	L	H	PHE	V	277
R	H	VAL	A	274	L	H	PHE	V	281
R	H	ARG	A	276	L	-	ARG	V	24
R	H	ARG	A	276	L	H	TRP	V	26
R	H	LEU	A	277	L	-	ARG	V	24
R	H	LEU	A	277	L	H	GLU	V	273
R	H	LEU	A	277	L	H	GLN	V	274
R	H	LEU	A	277	L	H	LYS	V	276
R	H	LEU	A	277	L	H	PHE	V	277
R	-	GLY	A	278	L	H	GLN	V	274
R	-	GLY	A	279	L	H	GLN	V	274
R	-	PRO	A	280	L	H	GLN	V	274
R	-	SER	A	282	L	H	TYR	V	261
R	H	LEU	A	283	L	H	LEU	V	257
R	H	LEU	A	283	L	H	TYR	V	261
R	H	LEU	A	284	L	H	PRO	V	258
R	H	LEU	A	284	L	H	ILE	V	278
R	H	LEU	A	284	L	H	PHE	V	281
R	H	VAL	A	287	L	H	LEU	V	254
R	H	VAL	A	287	L	H	LEU	V	257
R	H	MET	A	288	L	H	PHE	V	281
R	H	THR	A	291	L	H	LEU	V	254
R	H	LEU	A	295	L	H	MET	V	250
R	H	LEU	A	295	L	H	LEU	V	289
R	H	VAL	A	298	L	H	ARG	V	297
R	H	VAL	A	299	L	H	PHE	V	292
R	H	VAL	A	299	L	H	LEU	V	296
R	H	LEU	A	302	L	H	LEU	V	296
R	H	LEU	A	302	L	H	ARG	V	297
R	H	LEU	A	302	L	H	LYS	V	302
R	H	VAL	A	303	L	H	PHE	V	292
R	H	VAL	A	303	L	H	LEU	V	296
R	H	GLY	A	305	L	H	ARG	V	306
R	H	ALA	A	306	L	H	LEU	V	296
R	H	ALA	A	306	L	H	LYS	V	302
R	H	ALA	A	306	L	H	ARG	V	306
R	H	LYS	A	307	L	H	LEU	V	305
R	H	LYS	A	307	L	H	LEU	V	309
R	H	CYS	A	312	L	H	ARG	V	306
R	H	LEU	A	316	L	H	ARG	V	306
R	H	TRP	A	39	L	H	ALA	V	226
R	H	TRP	A	39	L	H	ARG	V	227
R	H	TRP	A	39	L	H	LEU	V	230
R	H	PHE	A	42	L	H	LEU	V	230
R	H	PHE	A	42	L	H	PHE	V	242
R	H	PRO	A	43	L	H	PHE	V	242
R	H	PRO	A	43	L	H	SER	V	246
R	H	PRO	A	43	L	H	LEU	V	249
R	H	PHE	A	46	L	H	HIS	V	239
R	H	PHE	A	46	L	H	PHE	V	242
R	H	PHE	A	46	L	H	GLY	V	243
R	H	PHE	A	46	L	H	SER	V	246
R	H	MET	A	47	L	H	ARG	V	297
R	H	LEU	A	50	L	H	HIS	V	239

- Title of columns started by 'R:' means Receptor, 'L:' means Ligand
- In the Secondary Structure columns: 'H' means that residues in that row are part of Alpha Helix; 'S' - Beta Sheet

Q5JQS5_Q8NGF3.5 contacts (residues & atoms)

Receptor	R: Secondary Structure	R: Atom	R: Residue	R; Chain	R: Residue number	Ligand	L: Secondary Structure	L; Atom	L: Residue	L: Chain	L: Residue Number
R	H	CD2	TRP	A	39	L	H	CB	ALA	V	226
R	H	CD2	TRP	A	39	L	H	HB1	ALA	V	226
R	H	CD2	TRP	A	39	L	H	HB2	ALA	V	226
R	H	CD2	TRP	A	39	L	H	HB3	ALA	V	226
R	H	CE2	TRP	A	39	L	H	CB	ALA	V	226
R	H	CE2	TRP	A	39	L	H	HB1	ALA	V	226
R	H	CE2	TRP	A	39	L	H	HB2	ALA	V	226
R	H	CE2	TRP	A	39	L	H	HB3	ALA	V	226
R	H	CE3	TRP	A	39	L	H	CB	ALA	V	226
R	H	CE3	TRP	A	39	L	H	HB1	ALA	V	226
R	H	CE3	TRP	A	39	L	H	HB2	ALA	V	226
R	H	CE3	TRP	A	39	L	H	HB3	ALA	V	226
R	H	CH2	TRP	A	39	L	H	CA	ALA	V	226
R	H	CH2	TRP	A	39	L	H	C	ALA	V	226
R	H	CH2	TRP	A	39	L	H	CB	ALA	V	226
R	H	CH2	TRP	A	39	L	H	HA	ALA	V	226
R	H	CH2	TRP	A	39	L	H	HB1	ALA	V	226
R	H	CH2	TRP	A	39	L	H	HB2	ALA	V	226
R	H	CH2	TRP	A	39	L	H	HB3	ALA	V	226
R	H	CH2	TRP	A	39	L	H	N	ARG	V	227
R	H	CH2	TRP	A	39	L	H	CD1	LEU	V	230
R	H	CH2	TRP	A	39	L	H	HD11	LEU	V	230
R	H	CH2	TRP	A	39	L	H	HD12	LEU	V	230
R	H	CZ2	TRP	A	39	L	H	CB	ALA	V	226
R	H	CZ2	TRP	A	39	L	H	HB1	ALA	V	226
R	H	CZ2	TRP	A	39	L	H	HB2	ALA	V	226
R	H	CZ2	TRP	A	39	L	H	HB3	ALA	V	226
R	H	CZ3	TRP	A	39	L	H	CA	ALA	V	226
R	H	CZ3	TRP	A	39	L	H	C	ALA	V	226
R	H	CZ3	TRP	A	39	L	H	CB	ALA	V	226
R	H	CZ3	TRP	A	39	L	H	HA	ALA	V	226
R	H	CZ3	TRP	A	39	L	H	HB1	ALA	V	226
R	H	CZ3	TRP	A	39	L	H	HB2	ALA	V	226
R	H	CZ3	TRP	A	39	L	H	HB3	ALA	V	226
R	H	CZ3	TRP	A	39	L	H	HD12	LEU	V	230
R	H	CA	PHE	A	42	L	H	CE1	PHE	V	242
R	H	CA	PHE	A	42	L	H	HE1	PHE	V	242
R	H	C	PHE	A	42	L	H	CE1	PHE	V	242
R	H	C	PHE	A	42	L	H	HD1	PHE	V	242
R	H	C	PHE	A	42	L	H	HE1	PHE	V	242
R	H	CB	PHE	A	42	L	H	CD1	PHE	V	242
R	H	CB	PHE	A	42	L	H	CE1	PHE	V	242
R	H	CB	PHE	A	42	L	H	CZ	PHE	V	242
R	H	CB	PHE	A	42	L	H	HE1	PHE	V	242
R	H	CB	PHE	A	42	L	H	HZ	PHE	V	242
R	H	O	PHE	A	42	L	H	HD1	PHE	V	242
R	H	O	PHE	A	42	L	H	HE1	PHE	V	242
R	H	CG	PHE	A	42	L	H	CE1	PHE	V	242
R	H	CG	PHE	A	42	L	H	CZ	PHE	V	242
R	H	CG	PHE	A	42	L	H	HE1	PHE	V	242
R	H	CG	PHE	A	42	L	H	HZ	PHE	V	242
R	H	CD1	PHE	A	42	L	H	CE1	PHE	V	242
R	H	CD1	PHE	A	42	L	H	CZ	PHE	V	242
R	H	CD1	PHE	A	42	L	H	HE1	PHE	V	242
R	H	CD1	PHE	A	42	L	H	HZ	PHE	V	242
R	H	CE1	PHE	A	42	L	H	HD23	LEU	V	230
R	H	CE1	PHE	A	42	L	H	HZ	PHE	V	242
R	H	CZ	PHE	A	42	L	H	HD23	LEU	V	230
R	H	N	PRO	A	43	L	H	HD1	PHE	V	242
R	H	N	PRO	A	43	L	H	HE1	PHE	V	242
R	H	CA	PRO	A	43	L	H	HB2	SER	V	246
R	H	CA	PRO	A	43	L	H	HB3	SER	V	246
R	H	CB	PRO	A	43	L	H	CB	SER	V	246
R	H	CB	PRO	A	43	L	H	HA	SER	V	246
R	H	CB	PRO	A	43	L	H	HB2	SER	V	246
R	H	CB	PRO	A	43	L	H	HB3	SER	V	246
R	H	CG	PRO	A	43	L	H	HA	SER	V	246
R	H	CG	PRO	A	43	L	H	HB2	SER	V	246
R	H	CG	PRO	A	43	L	H	HD13	LEU	V	249
R	H	CB	PHE	A	46	L	H	HB3	PHE	V	242
R	H	CG	PHE	A	46	L	H	CB	PHE	V	242
R	H	CG	PHE	A	46	L	H	HB3	PHE	V	242
R	H	CD1	PHE	A	46	L	H	HB3	PHE	V	242
R	H	CD1	PHE	A	46	L	H	HA2	GLY	V	243
R	H	CD1	PHE	A	46	L	H	OG	SER	V	246
R	H	CD1	PHE	A	46	L	H	HG	SER	V	246
R	H	CD2	PHE	A	46	L	H	CB	PHE	V	242
R	H	CD2	PHE	A	46	L	H	HB2	PHE	V	242
R	H	CD2	PHE	A	46	L	H	HB3	PHE	V	242
R	H	CE1	PHE	A	46	L	H	C	PHE	V	242
R	H	CE1	PHE	A	46	L	H	HB3	PHE	V	242
R	H	CE1	PHE	A	46	L	H	N	GLY	V	243
R	H	CE1	PHE	A	46	L	H	CA	GLY	V	243
R	H	CE1	PHE	A	46	L	H	HA2	GLY	V	243
R	H	CE1	PHE	A	46	L	H	HA3	GLY	V	243
R	H	CE1	PHE	A	46	L	H	OG	SER	V	246
R	H	CE1	PHE	A	46	L	H	HG	SER	V	246
R	H	CE2	PHE	A	46	L	H	O	HIS	V	239
R	H	CE2	PHE	A	46	L	H	CG	HIS	V	239
R	H	CE2	PHE	A	46	L	H	CD2	HIS	V	239
R	H	CE2	PHE	A	46	L	H	ND1	HIS	V	239
R	H	CE2	PHE	A	46	L	H	CE1	HIS	V	239
R	H	CE2	PHE	A	46	L	H	NE2	HIS	V	239
R	H	CE2	PHE	A	46	L	H	HA	HIS	V	239
R	H	CE2	PHE	A	46	L	H	HE1	HIS	V	239
R	H	CE2	PHE	A	46	L	H	HE2	HIS	V	239
R	H	CE2	PHE	A	46	L	H	HB2	PHE	V	242
R	H	CE2	PHE	A	46	L	H	HB3	PHE	V	242
R	H	CE2	PHE	A	46	L	H	N	GLY	V	243
R	H	CE2	PHE	A	46	L	H	H	GLY	V	243
R	H	CE2	PHE	A	46	L	H	HA2	GLY	V	243
R	H	CZ	PHE	A	46	L	H	ND1	HIS	V	239
R	H	CZ	PHE	A	46	L	H	CE1	HIS	V	239
R	H	CZ	PHE	A	46	L	H	HE1	HIS	V	239
R	H	CZ	PHE	A	46	L	H	HB3	PHE	V	242
R	H	CZ	PHE	A	46	L	H	N	GLY	V	243
R	H	CZ	PHE	A	46	L	H	CA	GLY	V	243
R	H	CZ	PHE	A	46	L	H	H	GLY	V	243
R	H	CZ	PHE	A	46	L	H	HA2	GLY	V	243
R	H	CZ	PHE	A	46	L	H	HA3	GLY	V	243
R	H	CG	MET	A	47	L	H	NH1	ARG	V	297
R	H	CG	MET	A	47	L	H	NH2	ARG	V	297
R	H	CG	MET	A	47	L	H	HH12	ARG	V	297
R	H	CG	MET	A	47	L	H	HH22	ARG	V	297
R	H	SD	MET	A	47	L	H	NH2	ARG	V	297
R	H	SD	MET	A	47	L	H	HH12	ARG	V	297
R	H	SD	MET	A	47	L	H	HH22	ARG	V	297
R	H	CD2	LEU	A	50	L	H	HE1	HIS	V	239
R	H	CD2	LEU	A	50	L	H	HE2	HIS	V	239
R	H	CA	GLY	A	228	L	H	HG12	VAL	V	33
R	H	NH2	ARG	A	245	L	H	CH2	TRP	V	313
R	H	NH2	ARG	A	245	L	H	CZ2	TRP	V	313
R	H	NH2	ARG	A	245	L	H	HZ2	TRP	V	313
R	H	NH2	ARG	A	245	L	-	HA3	GLY	V	317
R	H	O	ILE	A	255	L	H	HD22	LEU	V	41
R	H	CG2	ILE	A	255	L	H	HD22	LEU	V	41
R	H	CD1	ILE	A	255	L	H	HD12	LEU	V	44
R	H	C	LEU	A	258	L	H	HD11	LEU	V	41
R	H	CB	LEU	A	258	L	H	HD22	LEU	V	37
R	H	CB	LEU	A	258	L	H	HD11	LEU	V	41
R	H	CB	LEU	A	258	L	H	HD22	LEU	V	41
R	H	O	LEU	A	258	L	H	HD11	LEU	V	41
R	H	CG	LEU	A	258	L	H	HD22	LEU	V	37
R	H	CD1	LEU	A	258	L	H	CD2	LEU	V	37
R	H	CD1	LEU	A	258	L	H	HD22	LEU	V	37
R	H	CD1	LEU	A	258	L	H	HD23	LEU	V	37
R	H	CD2	LEU	A	258	L	H	CD1	LEU	V	37
R	H	CD2	LEU	A	258	L	H	CD2	LEU	V	37
R	H	CD2	LEU	A	258	L	H	HD12	LEU	V	37
R	H	CD2	LEU	A	258	L	H	HD13	LEU	V	37
R	H	CD2	LEU	A	258	L	H	HD22	LEU	V	37
R	H	CD2	LEU	A	258	L	H	HD23	LEU	V	37
R	H	N	CYS	A	259	L	H	HD11	LEU	V	41
R	H	CA	CYS	A	259	L	H	HD11	LEU	V	41
R	H	CA	CYS	A	259	L	H	HD12	LEU	V	41
R	H	CA	CYS	A	259	L	H	HZ	PHE	V	292
R	H	CB	CYS	A	259	L	H	CE1	PHE	V	292
R	H	CB	CYS	A	259	L	H	CZ	PHE	V	292
R	H	CB	CYS	A	259	L	H	HE1	PHE	V	292
R	H	CB	CYS	A	259	L	H	HZ	PHE	V	292
R	H	SG	CYS	A	259	L	H	CD1	LEU	V	41
R	H	SG	CYS	A	259	L	H	CD2	LEU	V	41
R	H	SG	CYS	A	259	L	H	HD11	LEU	V	41
R	H	SG	CYS	A	259	L	H	HD12	LEU	V	41
R	H	SG	CYS	A	259	L	H	HD22	LEU	V	41
R	H	SG	CYS	A	259	L	H	HD23	LEU	V	41
R	H	SG	CYS	A	259	L	H	CE1	PHE	V	292
R	H	SG	CYS	A	259	L	H	CE2	PHE	V	292
R	H	SG	CYS	A	259	L	H	CZ	PHE	V	292
R	H	SG	CYS	A	259	L	H	HE1	PHE	V	292
R	H	SG	CYS	A	259	L	H	HZ	PHE	V	292
R	H	CB	LEU	A	262	L	H	HD13	LEU	V	41
R	H	CG	LEU	A	262	L	H	HB2	LEU	V	37
R	H	CG	LEU	A	262	L	H	HB3	LEU	V	37
R	H	CG	LEU	A	262	L	H	HD12	LEU	V	37
R	H	CG	LEU	A	262	L	H	CD1	LEU	V	41
R	H	CG	LEU	A	262	L	H	HD11	LEU	V	41
R	H	CG	LEU	A	262	L	H	HD13	LEU	V	41
R	H	CD1	LEU	A	262	L	H	C	LEU	V	37
R	H	CD1	LEU	A	262	L	H	CB	LEU	V	37
R	H	CD1	LEU	A	262	L	H	HB2	LEU	V	37
R	H	CD1	LEU	A	262	L	H	HB3	LEU	V	37
R	H	CD1	LEU	A	262	L	H	HA	SER	V	38
R	H	CD1	LEU	A	262	L	H	CG	LEU	V	41
R	H	CD1	LEU	A	262	L	H	CD1	LEU	V	41
R	H	CD1	LEU	A	262	L	H	HG	LEU	V	41
R	H	CD1	LEU	A	262	L	H	HD11	LEU	V	41
R	H	CD1	LEU	A	262	L	H	HD12	LEU	V	41
R	H	CD1	LEU	A	262	L	H	HD13	LEU	V	41
R	H	CD2	LEU	A	262	L	H	HA	VAL	V	34
R	H	CD2	LEU	A	262	L	H	HG13	VAL	V	34
R	H	CD2	LEU	A	262	L	H	CB	LEU	V	37
R	H	CD2	LEU	A	262	L	H	CD1	LEU	V	37
R	H	CD2	LEU	A	262	L	H	HB2	LEU	V	37
R	H	CD2	LEU	A	262	L	H	HB3	LEU	V	37
R	H	CD2	LEU	A	262	L	H	HD11	LEU	V	37
R	H	CD2	LEU	A	262	L	H	HD12	LEU	V	37
R	H	CD2	LEU	A	262	L	H	HG	SER	V	38
R	H	CG2	VAL	A	263	L	H	HD22	LEU	V	289
R	H	CG1	VAL	A	266	L	H	CG1	ILE	V	285
R	H	CG1	VAL	A	266	L	H	CD1	ILE	V	285
R	H	CG1	VAL	A	266	L	H	HG12	ILE	V	285
R	H	CG1	VAL	A	266	L	H	HD11	ILE	V	285
R	H	CG1	VAL	A	266	L	H	HD12	ILE	V	285
R	H	CG2	VAL	A	266	L	H	CG1	VAL	V	34
R	H	CG2	VAL	A	266	L	H	HG12	VAL	V	34
R	H	CG2	VAL	A	266	L	H	HG13	VAL	V	34
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R	H	CB	LEU	A	302	L	H	HA	LEU	V	296
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R	H	O	LEU	A	302	L	H	CD2	LEU	V	296
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R	H	O	LEU	A	302	L	H	HZ2	LYS	V	302
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R	H	CD1	LEU	A	302	L	H	HD12	LEU	V	296
R	H	CD1	LEU	A	302	L	H	N	ARG	V	297
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R	H	CG2	VAL	A	303	L	H	CD1	PHE	V	292
R	H	CG2	VAL	A	303	L	H	HD1	PHE	V	292
R	H	CG2	VAL	A	303	L	H	HE1	PHE	V	292
R	H	CG2	VAL	A	303	L	H	CD1	LEU	V	296
R	H	CG2	VAL	A	303	L	H	CD2	LEU	V	296
R	H	CG2	VAL	A	303	L	H	HD11	LEU	V	296
R	H	CG2	VAL	A	303	L	H	HD12	LEU	V	296
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R	H	CG2	VAL	A	303	L	H	HD23	LEU	V	296
R	H	O	GLY	A	305	L	H	HH21	ARG	V	306
R	H	CA	ALA	A	306	L	H	HH21	ARG	V	306
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R	H	CB	ALA	A	306	L	H	HD3	LYS	V	302
R	H	CB	ALA	A	306	L	H	HE2	LYS	V	302
R	H	CB	ALA	A	306	L	H	HZ2	LYS	V	302
R	H	O	ALA	A	306	L	H	HE	ARG	V	306
R	H	O	ALA	A	306	L	H	HH21	ARG	V	306
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R	H	SG	CYS	A	312	L	H	CZ	ARG	V	306
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R	H	SG	CYS	A	312	L	H	HH22	ARG	V	306
R	H	CG	LEU	A	316	L	H	HH12	ARG	V	306
R	H	CD1	LEU	A	316	L	H	NH1	ARG	V	306
R	H	CD1	LEU	A	316	L	H	HH11	ARG	V	306
R	H	CD1	LEU	A	316	L	H	HH12	ARG	V	306
R	H	CD2	LEU	A	316	L	H	HH12	ARG	V	306

- Title of columns started by 'R:' means Receptor, 'L:' means Ligand
- In the Secondary Structure columns: 'H' means that residues/atoms in that row are part of Alpha Helix; 'S' - Beta Sheet

Krembil, Jurisica Lab. July 16, 2025 Database: 1.0.4.1